Фамилия Бумакова — женская форма, а её мужской вариант Бумаков. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Бумак. Что оно означало — вопрос, на который нет единого ответа, но есть несколько рабочих версий.

Самая прямая и правдоподобная отсылает к слову «бумага». В старину «бумагой» называли не только писчий материал, но и хлопок, вату. Прозвище Бумак могли дать человеку, который торговал хлопчатобумажными тканями, работал с ватой или, в более узком смысле, был писцом, подьячим — то есть имел дело с бумагами. В этом случае фамилия — типичный пример «профессионального» прозвища, перешедшего в фамилию.

Менее очевидная, но тоже возможная версия — связь с диалектным словом «бумакать» (бормотать, говорить невнятно). В некоторых говорах «бумакой» называли молчаливого, неразговорчивого человека. Однако эта гипотеза слабее, так как следов такого прозвища в исторических документах почти нет, в отличие от фамилий, образованных от названий занятий.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования: Бумак + ов = «сын Бумака» или «из семьи Бумака». Фамилия встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, что косвенно говорит о её происхождении в среде крестьян или посадских людей, а не дворянства — фамилии на -ов у дворянских родов чаще имеют иную, «книжную» основу.

Интересно сравнить Бумакова с однокоренными фамилиями Бумагин и Бумажников. Бумагин образован напрямую от слова «бумага», а Бумажников — более поздняя, «сословная» форма от названия ремесленника. Бумаков стоит особняком: в нём чувствуется не столько указание на материал, сколько на конкретного человека по прозвищу. Это делает фамилию не такой прозрачной, как кажется на первый взгляд, и заставляет искать её корни не в словаре, а в быту и диалектах.