Фамилия Бундакова — женская форма фамилии Бундаков, и её происхождение стоит искать не в красивой легенде, а в прозвище или имени предка. Основа здесь — «Бундак» или «Бундако». В русских говорах слово «бунда» или «бундак» имело несколько значений, и все они далеки от книжной романтики. Чаще всего так называли человека плотного, коренастого, сбитого — «бундатый» значило пухлый, толстый. В некоторых областях слово «бунда» означало просто брюхо, живот. Прозвище Бундак могли дать либо упитанному мужчине, либо, по контрасту, тому, кто любил плотно поесть.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть слово «бундак» (или «бундак»), означающее «здесь», «тут». Такое прозвище мог получить пришлый человек, которого местные называли «здешним» в ироничном смысле — как приезжего, который пытается стать своим. Однако эта версия слабее: прозвища от местоимений в русской ономастике редки, и гораздо вероятнее, что корень — славянский диалектный.

Суффикс «-ов» в фамилии Бундаков указывает на типичную для XVII–XIX веков модель образования от прозвища или имени отца: «чей?» — Бундаков, то есть сын или потомок Бундака. Фамилия преимущественно русская, встречается в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской, Ростовской и Волгоградской областях. Встречается она и у донских казаков, где прозвища по внешности были особенно распространены.

В отличие от фамилий, образованных от крестильных имён (Иванов, Петров), Бундаков — пример «мирского» прозвания, которое давали в быту и которое закрепилось за родом. Никакого дворянского или боярского корня у этой фамилии нет: её носили крестьяне, однодворцы и казаки. В дореволюционных переписях Бундаковы чаще всего записаны как государственные крестьяне, то есть лично свободные, но обязанные платить подати. Если искать однокоренные фамилии, то это Бундин, Бундов, Бундюков — они восходят к тем же диалектным основам, но с разными суффиксами.