Фамилия Бутникова — женская форма, образованная от мужской фамилии Бутников. В основе лежит прозвище Бутник, которое, в свою очередь, восходит к глаголу «бутить». В строительном деле «бутить» означало заваливать яму, ров или воду камнем с землёй, либо забивать ров щебнем, кирпичом и заливать известью для крепости. Соответственно, Бутником называли человека, который занимался этой работой — землекопа или каменщика, занятого устройством фундаментов и мостовых.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Бутник- добавлен типичный русский суффикс принадлежности -ов, указывающий на «сына Бутника» или «человека из дома Бутника». Окончание -а в Бутникова — грамматический показатель женского рода, означающий, что носительница фамилии является дочерью, женой или вдовой Бутникова.

Интересно, что прозвище Бутник могло закрепиться не только за профессиональным строителем. В некоторых говорах «бутить» имело переносное значение — «говорить вздор, нести чепуху». Однако эта версия менее вероятна: фамилии от профессиональных прозвищ встречаются в русской ономастике гораздо чаще, чем от бытовых характеристик поведения.

Фамилия Бутников (и, соответственно, Бутникова) не относится к числу распространённых дворянских фамилий. Скорее всего, её носили крестьяне или посадские люди, чьи предки работали по найму на тяжёлых земляных или каменных работах. Встречается она преимущественно в центральных и южных областях России, где активно велось каменное строительство и мощение дорог.

Таким образом, предки человека с фамилией Бутникова, по всей вероятности, были людьми физического труда, которые в буквальном смысле «бутили» — укладывали камень и щебень, создавая основы для зданий и дорог.