Фамилия Бутылкина образована от прозвища или нецерковного имени Бутылка. Чаще всего её объясняют через слово «бутылка» — стеклянный сосуд для вина. Отсюда две бытовые версии: прозвище могли дать либо виноделу, либо человеку, неравнодушному к спиртному. Однако это лишь самое очевидное толкование.

Менее известное, но не менее весомое значение слова «бутылка» — рудничный ящик ёмкостью до 50 пудов руды. В горном деле такое прозвище мог получить рабочий, занятый на добыче или транспортировке руды. Эта версия особенно правдоподобна для уральских и сибирских регионов, где горнодобыча была основным промыслом.

Третья версия отсылает к сибирскому слову «бутыл» — так называли грубую просторную обувь, бахилы или бродни. В крестьянском быту Сибири бутылы были обычной рабочей обувью, и прозвище Бутылка мог получить либо тот, кто их носил, либо сапожник, который их шил.

По словообразовательной модели фамилия относится к типично русскому типу на -ин. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Бутылкин, то есть сын, потомок Бутылки. Такая модель в XVI–XVII веках была распространена в среде крестьян и посадских людей, реже — у служилых.

Географически фамилия встречается в разных областях России, но заметно чаще — в Поволжье и на Урале. Это косвенно подтверждает «горную» версию происхождения, так как именно там были сосредоточены рудники и заводы.

Итог: у фамилии Бутылкина как минимум три равноправных корня — винодельческий, горнорабочий и обувной. Выбрать единственный без точных сведений о предках невозможно, но все три объяснения укладываются в логику русских прозвищ по ремеслу или характерной вещи.