Фамилия Бузенюс — редкий случай, когда литовское происхождение почти не вызывает споров. Она образована по типичной литовской модели с суффиксом -юс (-ius), который в литовской антропонимии часто указывает на принадлежность к роду или на носителя определённого качества. В русском окружении такие фамилии нередко получали окончание -ус или -юс, сохраняя исходную балтскую основу.

Основа «бузен-» восходит к литовскому «būzė» — так в некоторых диалектах называли губу или нечто вздутое, набухшее. Слово могло стать прозвищем человека с пухлыми губами или с капризным, надутым выражением лица. В переносном смысле «būzė» иногда означало упрямца или брюзгу. Таким образом, Бузенюс — это «сын Бузиса» или «тот, кто из рода Бузиса», где Бузис — человек, получивший прозвище по внешности или характеру.

Географически фамилия тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи. Встречается в Литве, на северо-западе Беларуси и в восточной Польше — на территориях, где исторически жили балтоязычные народы, а затем сформировалась польско-литовская шляхта. В метрических книгах XIX века Бузенюсы фиксируются как крестьяне и мелкая шляхта в Виленской и Ковенской губерниях.

На письме фамилия могла варьироваться: Бузенюс, Буженюс, Бузенус. В русских документах её часто записывали через «у» после «з», но с сохранением окончания -юс, что выдаёт неадаптированное литовское происхождение. Другие фамилии с тем же корнем — Бузис, Буза, Бузенков — но Бузенюс стоит особняком благодаря суффиксу, который почти не встречается у восточнославянских фамилий.

Версия о происхождении от польского «buźnić» (дразнить, корчить рожи) менее убедительна: это слово позднее и локальное, а литовская основа с суффиксом -юс даёт более стройную словообразовательную модель. Так что предки носителя фамилии Бузенюс, скорее всего, говорили по-литовски или по-белорусски с сильным балтским субстратом, а их прозвище закрепилось в документах на польском или русском языке.