Фамилия Чапуркина — вариант женской формы, мужская — Чапуркин. Её основа — прозвище или имя Чапурка, а само слово «чапурка» в русских говорах имеет несколько значений, что и создаёт простор для версий происхождения.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «чапать» — хватать, брать, цеплять. В этом случае Чапуркой могли прозвать хваткого, цепкого человека, того, кто умело «загребает» себе добро. В псковских и тверских говорах «чапурка» — это деревянная задвижка, щеколда. Прозвище могли дать по сходству с этой деталью: либо человеку, который «запирается» и нелюдим, либо, наоборот, тому, кто постоянно «закрывает» дела.

Словообразовательная модель фамилии стандартна для русского Северо-Запада: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Чапуркин). Это типичная «семейная» фамилия, образованная от прозвища отца, и исторически она бытовала в новгородских и псковских землях. Фамилия не дворянская и не купеческая — скорее всего, её носили крестьяне или посадские люди, чьё прозвище закрепилось в документах XVI–XVII веков.

Менее убедительна версия о связи с украинским или южнорусским «чапурка» в значении «цапля». Хотя цапля — заметная птица, прозвище «Цапля» было бы более ожидаемым. Звуковой переход «ц» в «ч» в этой позиции нехарактерен для русского языка, поэтому версия с птицей проигрывает диалектной «хваткой» или «задвижке». Таким образом, предок современных Чапуркиных, скорее всего, был человеком цепким, деловым или, наоборот, замкнутым — в зависимости от того, какое из значений «чапурки» закрепилось за ним в говоре его местности.