Фамилия Чарапкин — одна из тех, где корень на первый взгляд неочевиден, но при ближайшем рассмотрении проясняется довольно быстро. В её основе лежит слово «чарап» — так в некоторых русских говорах, особенно в северных и сибирских, называли черепок, глиняный обломок, а также горшок или плошку. Слово это — диалектный вариант общеизвестного «череп», с характерным аканьем (переход «е» в «а» под ударением в некоторых говорах не происходил, а в безударной позиции звук редуцировался). Таким образом, Чарапкин — потомок человека, которого в старину прозвали Чарапком по какой-то внешней или бытовой примете: возможно, он был горшечником, торговал глиняной посудой, имел лысину (голову, похожую на черепок) или, наоборот, был худ и костляв.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей сын?» — Чарапкин, то есть сын Чарапка. Эта модель образования — от прозвища или мирского имени, оканчивающегося на согласный, — одна из самых распространённых в русской антропонимии. Важно, что фамилия не переосмысливалась через более позднее слово «череп»: она сохранила именно диалектную, «окающую» или «акающую» форму, что может указывать на конкретный регион бытования. Скорее всего, предки Чарапкиных жили на территории, где было распространено слово «чарап» — это северные области России (Архангельская, Вологодская губернии) или Поволжье.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) фамилии на «-ап-» в корне нередко объясняются как фонетические варианты «-ереп-», «-ороп-». Версия о связи с «черепом» — основная и наиболее правдоподобная. Менее вероятно, но не исключено, что прозвище Чарап могло произойти от глагола «чарапать» (царапать, скрести) — тогда оно относилось к человеку с резким, неуживчивым характером или к тому, кто занимался скребущей работой (например, скоблил кожи). Однако в этом случае ожидалась бы форма «Чарапкин» от «Чарапка» (царапка), а не от «чарап», что делает версию с черепком более логичной.

Социальный слой, из которого вышла фамилия, — скорее всего, крестьянская или ремесленная среда. Фамилии на «-ин» в массе своей принадлежали непривилегированным сословиям, и Чарапкин не исключение: прозвище по предмету быта или внешности типично для простых людей. Встречаемость фамилии сегодня невысокая, она относится к редким, что подтверждает её узкую диалектную основу. В написании возможны варианты «Черепкин» (от литературного «череп») — это уже другая фамилия, но однокоренная, и её носители могли быть рассеяны шире.