Фамилия Чарнецкая — женская форма фамилии Чарнецкий, и её ключ к пониманию лежит в корне «чарн-», который восходит к польскому или белорусскому слову «czarny» (чёрный). В русском языке этот корень звучал бы как «черн-», но здесь мы видим характерную западнославянскую передачу: «а» вместо «е». Такая модель образования на -ский/-цкий типична для шляхты и дворянства Речи Посполитой, а также для украинских и белорусских земель, находившихся под её влиянием. Суффикс -цк- (вместо -ск-) — результат фонетического смягчения: если основа слова заканчивается на задненёбный согласный (к, г, х), то при добавлении -ский он переходит в -цк-, -зк-, -ск- соответственно. В случае с «czarny» такого перехода не было бы, но в польском языке существует фамилия Czarniecki, которая могла быть русифицирована как Чарнецкий.

Что означало исходное прозвище? «Чёрный» — один из самых распространённых признаков во всех славянских фамильных системах. Оно могло указывать на цвет волос или кожи (смуглый, темноволосый человек), на тёмную одежду (например, крестьянин, носивший чёрный зипун) или на род занятий (угольщик, кузнец — работа с сажей). В шляхетской среде прозвище Czarny нередко давали за мрачный нрав или суровый вид, но чаще оно было просто описательным, без негативного оттенка.

Географически фамилия Чарнецкая и её мужской вариант Чарнецкий наиболее часты в западных регионах современной России (Смоленская, Брянская области), в Беларуси и на востоке Польши. Встречается она и в Украине, но реже. Исторически носители этой фамилии могли быть служилыми людьми (мелкопоместная шляхта), которые после разделов Речи Посполитой переходили на русскую службу и получали поместья. Однако не стоит исключать и крестьянское происхождение: в XIX веке фамилии на -ский/-цкий давали бывшим униатским священникам или просто грамотным крестьянам, но для Чарнецких это менее вероятно — корень слишком «говорящий» и мог принадлежать любому сословию.

В русских документах фамилию могли записывать с вариациями: Чарницкая, Чернецкая, Черницкая. Последняя форма (Чернецкая) — более русифицированная, но она уже будет означать не «чёрный», а, возможно, «чернец» (монах) или «чернь» (простой народ). Для Чарнецкой же связь с цветом остаётся основной и самой правдоподобной.