Фамилия Чебоксарцев — одна из немногих, что напрямую отсылает к названию крупного города. Её основа — топоним «Чебоксары» (столица Чувашии). Человек, получивший такое прозвище, скорее всего, был выходцем из этих мест: либо родился в Чебоксарах, либо долго там жил, либо владел там имуществом. В русской ономастике прозвища по месту жительства — обычный способ выделить человека в общине переселенцев или в среде пришлых людей.

Модель образования фамилии необычна. В ней сочетаются два суффикса: сначала «-ар-», который в данном случае входит в основу названия города (Чебоксар-ы), а затем «-ев-». Суффикс «-ев» — типичный русский патронимический, указывающий на принадлежность («чей?»). Но здесь он присоединён не к личному имени, а к прозвищу: «Чебоксарец» — человек из Чебоксар. От этого прозвища через суффикс «-ев» и получилась фамилия Чебоксарцев. Буквальное значение: «сын чебоксарца», то есть потомок человека из Чебоксар.

Интересно, что фамилия могла закрепиться не в самом городе, а за его пределами. Внутри Чебоксар прозвище «чебоксарец» было бы избыточным — там все местные. А вот в соседних сёлах, в других губерниях или на Урале, куда уходили переселенцы, такое прозвище точно выделяло человека. Поэтому географически фамилия Чебоксарцев встречается не только в Чувашии, но и в Поволжье, на Урале и в Сибири — там, где оседали выходцы из этого региона.

Редкость фамилии придаёт и её окончание. Вариант Чебоксарцев (с «-ев») встречается чаще, чем Чебоксарцов (с «-ов»), но оба они — результат адаптации твёрдой основы «Чебоксар-» к русским фамильным моделям. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (Чебоксаров, Чебоксарский), то Чебоксарцев — самая «прозвищная» форма, прямо указывающая на происхождение первого носителя.