Фамилия Чеклунова — женская форма фамилии Чеклунов, и её разбор стоит начать с мужского варианта, так как именно он хранит ключ к происхождению. Чеклунов — фамилия относительно редкая, но её словообразовательная модель прозрачна и уводит нас в мир прозвищ и профессиональных занятий Древней Руси.

В основе фамилии лежит прозвище Чеклун. Корень «чек-» здесь не связан с банковскими чеками, а восходит к глаголу «чекать», который в ряде русских говоров означал «бить, ударять», «отбивать», «чеканить». Чеклуном могли назвать человека, занятого чеканкой — обработкой металла, изготовлением монет или украшений. Это одна из самых правдоподобных версий: предок носителя фамилии был ремесленником-чеканщиком.

Суффикс «-ун» в русском языке часто образует названия лиц по характерному действию (например, «болтун», «молчун»). Чеклун — тот, кто чеканит, кто постоянно занят чеканкой. Форма на «-ов» стандартно указывает на принадлежность: Чеклунов — сын Чеклуна, потомок человека с таким прозвищем. Таким образом, фамилия прямо говорит о роде занятий основателя: он был мастером по металлу, возможно, оружейником или ювелиром.

Существует и менее очевидная версия, связывающая фамилию с диалектным словом «чекла» или «чокла» — так в некоторых областях называли деревянную колотушку, молоток. В этом случае Чеклун — человек, который делает или использует такие колотушки, например, бондарь или плотник. Однако первая версия (с чеканкой) выглядит более убедительной, так как глагол «чекать» широко распространён и дал много производных фамилий (Чеканов, Чекалин, Чекалкин).

География фамилии Чеклуновых не обширна, но устойчива: чаще всего она встречается в центральных и южных регионах России, а также на Урале — в местах, где исторически были развиты ремёсла, связанные с обработкой металла. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или мещанской, так как прозвища по профессии были типичны для непривилегированных слоёв населения. Дворянских родов с такой фамилией в исторических документах не зафиксировано.