Фамилия Чекуджан образована от аналогичного имени, которое, как и большинство восточных имен, состоит из двух частей: Чеку и Джан. Первая из них восходит к древнетюркскому слову «чека», которое на русский язык переводится как «дитя». Второй компонент данного имени ведет свое начало о слова «джан», означающего в переводе с персидского языка «душа, жизнь». Вполне вероятно, что родоначальник Чекуджан был долгожданным ребенком в семье.