Фамилия Чекуова — редкий случай, когда написание говорит о происхождении больше, чем корень. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Чекуо́ва. Сама форма на -ова указывает, что перед нами женский вариант фамилии, а мужская звучала бы как Чекуо́в. Но это не типичная русская фамилия: суффикс -уо- в корне для славянских языков нетипичен.

Наиболее вероятное объяснение — осетинское происхождение. В осетинском языке есть фамилии, образованные от личных имён или прозвищ с основой «Чек», «Чех» или «Цех». Суффикс -уо- мог возникнуть при адаптации осетинской фамилии на русский лад: исходная форма вроде Чекоева или Цекоева при записи в документах исказилась, и вместо привычного -оев- появилось -уов-. Такое нередко случалось при переписи населения в XIX — начале XX века, когда писарь записывал фамилию на слух, не зная её точного написания.

Менее вероятная, но возможная версия — тюркские корни. В некоторых тюркских языках (кумыкском, ногайском) есть слово «чек» или «чеку» — «рубеж», «граница», «зарубка». Тогда Чекуов — потомок человека по прозвищу Чеку, то есть «пограничник» или «тот, кто ставит метки». Однако в таком случае фамилия обычно писалась бы как Чекуев, а не Чекуов, поэтому эта гипотеза слабее.

География фамилии подтверждает осетинскую версию. Основная масса носителей Чекуовых живёт на Северном Кавказе, особенно в Северной Осетии. Встречается она и среди кабардинцев, что объяснимо историческими контактами народов.

Таким образом, если вы ищете свои корни по фамилии Чекуова, вам стоит в первую очередь смотреть в сторону осетинских фамильных преданий и родовых имён, а не искать её в центральных русских губерниях.