Основой фамилии Чемеркин послужило мирское имя Чемерка. Фамилия Чемеркин образована от мирского имени Чемерка, которое восходит к аналогичному нарицательному. «Чемерка» - это название многолетней травы из семейства Лилейных. Известно до 9 видов этого растения, дико растущих в лесной области восточного и западного полушария. До введения на Руси христианства наречение ребёнка именем, представляющим собой название растения или животного, было очень распространённой традицией. Давая младенцу такое имя, как Чемерка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделено это растение. Согласно другой, менее правдоподобной версии, фамилия Чемеркин образована от прозвища Чемерка. Так могли называть человека, занимающегося сбором лечебной травы Черемицы, которая в народной медицине использовалась для лечения скота. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Чемерка, со временем получил фамилию Чемеркин.