Фамилия Чемерков — одна из тех, где корень сразу бросается в глаза, но точное значение угадать непросто. Основа здесь — «чемер» или «чемерка», слово с несколькими возможными источниками. Самое прямое объяснение лежит в диалектной лексике: в южнорусских и украинских говорах «чемер» означало «чепрак», то есть подстилку под седло, или просто «потник». Человек, делавший или продававший такие вещи, мог получить прозвище Чемер, а его потомки — фамилию Чемерков. Суффикс -ов- стандартно указывает на принадлежность: «чей? — Чемерков», то есть сын, внук или работник Чемера.

Есть и вторая, более тёмная версия. В некоторых областях «чемер» называли «черемис» — устаревшее название марийцев. Если предок носил прозвище по этническому признаку, фамилия могла закрепиться в форме Чемерков, но это менее вероятно: обычно такие прозвища давали напрямую (Черемис, Черемисин), а «чемер» — скорее местный вариант слова. Третья гипотеза связывает корень с «чемерка» — видом растения или даже с «чемером» как названием болезни (куриная слепота), но тут слишком много допущений, чтобы считать это главным.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: прозвище на -а/-о (Чемер) плюс суффикс -ков. Интересно, что фамилия почти не встречается за пределами России — это редкий случай, когда основа связана с конкретным ремесленным или бытовым термином, а не с крестильным именем. Среди носителей преобладают жители центральных и южных областей, что косвенно подтверждает связь с коневодством или конной упряжью.

Если сравнивать с однокоренными, то Чемерков стоит в одном ряду с Чемерисовым и Чемеркиным, но последние встречаются ещё реже. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» этот корень не упоминается отдельно, что говорит о его узкой диалектной природе. Для тех, кто носит эту фамилию, самая вероятная история предка — мастер по конской сбруе или торговец в приграничных с Украиной губерниях.