Фамилия Чепулюнис звучит необычно для русского уха, и это прямой намёк на её происхождение. Перед нами не славянская, а литовская фамилия. Её выдают два характерных признака: конечное -ис (в мужском роде) и основа, которую можно разобрать по литовским словообразовательным моделям.

В литовском языке мужские фамилии в именительном падеже чаще всего оканчиваются на -ас, -ис или -ус. Окончание -ис в фамилии Чепулюнис — это стандартный патронимический суффикс, указывающий на принадлежность: «сын такого-то» или «потомок такого-то». Корень, скорее всего, восходит к литовскому слову čepulis или čepulys. В литовской диалектной лексике čepulys означает «тряпка», «лоскут», «ветошка», а в переносном смысле — «неряха» или «неопрятный человек». Прозвище Чепуля (Čepulė) могли дать небрежно одетому человеку или тому, кто занимался переработкой тряпья, например, тряпичнику.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с глаголом čepti — «жарить», «печь». В таком случае прозвище могло относиться к повару или пекарю. Однако семантика «тряпки» встречается в литовских говорах чаще и даёт более прямое прозвище.

Интересно, что фамилия Чепулюнис — это не просто застывшая форма, а живой пример литовского антропонимикона, который почти не пересекается с русским. В русском языке нет суффикса -юнис, и фамилии на -ис, как правило, указывают на балтийские корни носителя. Встретить такую фамилию можно в Литве, а также в Латвии и среди литовской диаспоры. В России она редка и, скорее всего, попала туда в советское время при миграции или через браки. Разбор фамилии Чепулюнис — это хороший пример того, как окончание и корень сразу выдают национальную принадлежность предка, уводя нас в литовскую деревню, где прозвище по внешнему виду или занятию закрепилось за целым родом.