Фамилия Черепнин образована от прозвища Черепень. По одной из версий, оно ведет свое начало от нарицательного «черепан» - «гончар». Возможно также, что основой для прозвища послужило диалектное слово «черепня» - «большая глиняная чашка», «гололедица». В таком случае Черепнем либо называли полного, тучного человека, либо ребенка, рожденного в пору гололеда (после оттепели или в сильный мороз). Согласно еще одной гипотезе, прозвище связано с существительным «черепенник» - «оладушек из гречневой муки, обжаренный на постном масле». Согласно этому, Черепнем могли называть пекаря или торговца мучными изделиями. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Черепень, со временем получил фамилию Черепнин.