Фамилия Черкин восходит к существительному «черки» (или «чарки»), т.е. обычная сибирская обувь с суконною опушкой. Скорее всего, предок обладателя этой фамилии был сапожником и шил такую обувь, за что и получил прозвище Черка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Черка, со временем получил фамилию Черкин.