Фамилия Чернеко звучит на украинский лад, хотя встречается и у русских, и у белорусов. Её основа — прилагательное «черный», но суффикс -ко указывает на иной механизм образования, чем у русских фамилий на -ов/-ев.

В украинской и польской ономастике суффикс -ко — уменьшительный или патронимический. Он мог означать «сын такого-то» или «маленький, младший». Соответственно, Чернеко — это, скорее всего, «сын Черного» или «маленький Черный». Но кто такой «Черный»? В древнерусской и украинской традиции это не обязательно цвет волос. Прозвище Черный могли дать человеку со смуглой кожей, темными глазами, а также тому, кто занимался «черной» работой — ремеслом, не связанным с земледелием, или носил темную одежду (например, монах или крестьянин, не имевший светлой праздничной сряды). В некоторых говорах «черный» означал «простой, незнатный, податной» человек.

Есть и другая версия, менее вероятная, но любопытная: в польском языке «czerniec» — это монах (чернец), а «czerneko» могло быть прозвищем монастырского слуги или человека, похожего на монаха. Однако суффикс -ко в этой модели реже встречается с названиями профессий, чаще — с личными именами и прозвищами.

Фамилия Чернеко зафиксирована преимущественно на Левобережной Украине, в Черниговской и Полтавской областях, а также в южных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках. Встречается она и в Беларуси, особенно в Гомельской области, что подтверждает её западнорусские корни.

Интересная деталь: фамилия Чернеко могла образоваться не напрямую от прозвища, а от имени Чернек — так в старину иногда называли ребенка, родившегося с темными волосами или в семье, где уже были «белые» (Беляк, Беляев). Тогда Чернеко — это не сын Черного, а просто Чернек, к которому добавили типичный для украинских фамилий суффикс. В любом случае, значение сводится к одному: предок носителя фамилии был либо темноволосым, либо «черным» по социальному или бытовому признаку.