Фамилия Черне — редкий случай, когда привычная русскому уху модель образования может ввести в заблуждение. На первый взгляд кажется, что перед нами фамилия с типичным окончанием -е, как у множества украинских или польских фамилий (Шевченко, Коваленко). Но на самом деле Черне — это застывшая форма краткого прилагательного или прозвища, и ударение в ней падает на последний слог: Черне́.

Корень здесь — «черн-», обозначающий чёрный цвет. В древнерусском языке слово «черне» (или «чернь») могло относиться к человеку с тёмными волосами, смуглой кожей или к тому, кто носил чёрную одежду, например, монаху (от слова «чернец»). Однако самая вероятная версия — прозвище по роду занятий. «Черне» на Руси нередко называли ремесленника, работавшего с чёрным металлом: кузнеца, оружейника или мастера по чернению серебра. Такое прозвище давали не за внешность, а за профессиональную связь с сажей, углём и металлом.

Словообразовательная модель фамилии необычна для восточнославянского ареала. В русской традиции фамилии на -е чаще всего встречаются у потомков украинских или белорусских переселенцев, где усечённые формы прозвищ были нормой. Но в случае с Черне мы имеем дело с полной редукцией суффикса: не Чернецов, не Чернев, а просто Черне — как будто прозвище законсервировалось без изменений. Такое возможно в среде, где фамилия закрепилась в форме именительного падежа единственного числа, что характерно для некоторых северных говоров или для фамилий, возникших в среде духовенства.

Географически фамилия Черне тяготеет к юго-западу России и востоку Украины. Встречается она редко, что делает её своеобразным маркером: если вы носите фамилию Черне, ваши предки с высокой вероятностью были либо кузнецами, либо людьми, получившими прозвище за тёмный облик, но в любом случае — жителями тех мест, где фамилии формировались не по столичным канонам, а по местным, более архаичным правилам.