Фамилия Чернецких — редкий пример «застывшей» формы родительного падежа множественного числа, типичной для северных и северо-восточных областей России. Суффикс -их (в исходной форме Чернецких) указывает на принадлежность к целому роду или дому: «из дома Чернецов», «из семьи Чернецких». Такие фамилии особенно характерны для Вятской, Пермской, Архангельской губерний, а также для казачьих областей, где бытовала модель «чей?» — ответ на вопрос: «Чьих будете? — Чернецких».

Основа фамилии — прозвище Чернец. В древнерусском языке «чернец» — это монах (от слова «чёрный» — по цвету монашеской одежды). Прозвище могли дать не только тому, кто принял постриг, но и человеку, который вёл аскетичный образ жизни, носил тёмную одежду или отличался мрачноватым нравом. В некоторых говорах «чернецом» называли человека с очень тёмными волосами или даже чёрного зверя — например, медведя-чернеца.

Словообразовательная модель здесь нестандартна. Обычно от прозвища Чернец образовывали фамилию Чернецов (с суффиксом -ов), и она встречается гораздо чаще. Форма Чернецких — более архаичная и локальная. Она не указывает на конкретного предка, а сразу на целый клан: «потомки того, кого звали Чернец». Это делает фамилию социально маркированной — она могла принадлежать крестьянам или посадским людям, которые не имели закреплённой фамильной традиции, а назывались по отцу или по прозвищу всей семьёй.

Любопытная деталь: в писцовых книгах XVI–XVII веков встречаются записи «Чернец Фёдоров сын» или «Чернец Иванов», где прозвище стоит на месте имени. Позже такие записи превращались в фамилии. Если предок носителя фамилии Чернецких действительно был монахом, то это мог быть человек, по какой-то причине покинувший монастырь и осевший на земле — вольный «чернец» без сана. Но не стоит исключать и чисто бытовое происхождение: в деревнях «чернецом» могли дразнить угрюмого или нелюдимого соседа.

Встречаемость фамилии сегодня — низкая, сосредоточена в основном в Кировской области, Удмуртии и Пермском крае. За пределами этих регионов Чернецких почти нет, что подтверждает её севернорусское происхождение.