Фамилия Черниов — редкий случай, когда написание подсказывает происхождение больше, чем звучание. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Чернио́в. Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель (чей? — Черниов), то есть фамилия образована от личного имени или прозвища предка. Но основа здесь не «Черн», а «Чернио».

Самая вероятная версия: в основе лежит прозвище Черни́й. В русских говорах «черний» — это не просто черный, а тот, кто занимается черной, тяжелой, грязной работой: чернорабочий, пахарь, либо человек, постоянно ходящий в саже и копоти (кузнец, печник, кочегар). Форма «Черний» могла быть усечением от канонического имени Чернислав или от прилагательного «черный» с суффиксальным оформлением. Фамилии с окончанием на -ий (Черний) при присоединении суффикса -ов дают форму Черниов, а не Чернов — это грамматически верно.

Менее вероятно, хотя лингвистически возможно, что основа — редкое нецерковное имя Чернио, которое могло быть заимствованием из греческого (черный, темный) или искусственным книжным образованием. Но в бытовой среде XVI–XVII веков такие имена встречались единично, поэтому версия с прозвищем Черний надежнее.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — в переписях XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Черний в Вологодской и Костромской губерниях. Социально это почти наверняка крестьянская или посадская среда: дворянские роды с такой основой не зафиксированы.

Однокоренные фамилии — Чернов, Черняев, Черниговский — разошлись по разным моделям. Черниов стоит особняком: его написание сохраняет след того самого прозвища Черний, которое в других случаях давно стерлось бы в произношении.