Фамилия Чернодырка — редкий пример прозвища, которое перешло в фамилию без изменений, без суффиксов -ов, -ев или -ин. Такие «чистые» фамилии чаще встречаются на Украине и в южнорусских говорах, где прозвища могли закрепляться в быту и документах без переоформления. Формально это существительное женского рода, но носителем фамилии мог быть и мужчина: в крестьянской среде прозвище часто давали по характерной черте, а не по грамматическому роду.

Основа фамилии прозрачна: «чёрный» и «дырка». Но смысл не буквальный. Вряд ли предка звали за физическую «дыру» — скорее за метафорическое качество. В русских говорах «чёрная дыра» могла означать глухое, непроходимое место, болото или овраг. Человек, живший в такой глуши, мог получить прозвище Чернодырка. Другая версия — ремесленная: так могли назвать трубочиста, печника или кузнеца, чья работа оставляла на одежде и лице чёрные следы, а «дырка» намекала на печную тягу или горн. В словарях русских прозвищ встречаются похожие образования — Чернорот, Чернорыл, Чернозуб, — все они описывают внешнюю примету или род занятий.

По суффиксальной модели фамилия стоит особняком. Обычно «дырка» в фамилиях оформляется суффиксами: Дыркин, Дырочкин. Чернодырка же осталась в исходной форме, что говорит о поздней фиксации — скорее всего, в XIX веке, когда перепись населения записывала прозвище так, как его слышала, без попыток «облагородить» окончанием. Это типично для однодворческих и казачьих фамилий юга России.

География фамилии узкая. По данным открытых источников, Чернодырка встречается в основном в Воронежской области и на Кубани — регионах, где исторически смешивались великорусские и малороссийские говоры. Встречаются единичные носители на Урале, но это, скорее всего, результат поздних миграций.

Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или однодворческая. Фамилия не звучит как дворянская или купеческая — слишком бытовая и прямая. Зато она даёт живую зарисовку: предок мог быть человеком нелюдимым, жившим на отшибе у чёрного оврага, или мастеровым, чья работа оставляла след сажи. В любом случае, Чернодырка — не случайный набор слов, а меткое прозвище, за которым стоит узнаваемый образ.