Фамилия Черной — редкий пример «окающего» написания, которое сохранило старую орфографию. Гораздо чаще встречается вариант с «ё» — Чёрный, но форма Черной не менее показательна. В дореволюционной России буква «ё» была факультативной, и многие фамилии фиксировались с «е»: Черной, Семенов, Лебедев. После реформы 1918 года часть носителей сменила написание на современное, а часть осталась при старом. Так что Черной — не ошибка, а живой след письменной традиции XIX — начала XX века.

Основа фамилии — прозвище Чёрный. В Древней Руси его давали по внешности: за тёмные волосы, смуглую кожу или глаза. Но был и социальный оттенок: «черными» называли простых, незнатных людей, в отличие от «белого» духовенства или «красных» бояр. В крестьянской среде прозвище могло закрепиться за человеком, который носил тёмную одежду, работал с сажей или углём, либо жил в «чёрной» (курной) избе.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Обычно прилагательное в мужском роде давало фамилии на -ов (Чернов) или -ский (Черновский). Но форма Черной — это застывшее прилагательное в именительном падеже, без суффикса. Такая модель встречается у «цветных» фамилий: Белой, Красной, Седой. Она указывает, что прозвище было настолько устойчивым, что перешло в фамилию без изменений.

Встречается Черной преимущественно на юге России и Украине, где «окающий» говор был распространён. В украинском языке фамилия Чорной (Чорний) тоже писалась через «о». По переписям XIX века, Черно́й (с ударением на второй слог) фиксировали у казаков и государственных крестьян Черниговской и Полтавской губерний. Ударение на первый слог (Чёрной) — более редкий вариант, характерный для великорусских говоров.

Споров о происхождении здесь почти нет: все версии сходятся на прозвище по цвету. Единственная альтернатива — связь с тюркским «кара» (чёрный), но для славянской фамилии это избыточное усложнение. Прямее и правдоподобнее считать, что предок носителя был просто черноволосым или смуглым человеком, а буква «о» в конце — не более чем дань старой орфографии.