Фамилия Честокина звучит необычно, и ключ к её разгадке лежит не в корне, а в суффиксе. Это классическая «малая родина»: фамилия образована от названия деревни или села с основой Честок-/Чисток-. Самый вероятный топоним — деревня Честоки или Чистоки, которые встречаются в старых писцовых книгах, например, на территории бывшего Московского государства. Жителя такой деревни называли «честокинец» или «честокин», отсюда и пошла фамилия.

Основа «честок-» — сложная. Скорее всего, это вариант слова «чисток»: место, где вырублен, «очищен» лес под пашню. В диалектах «честить» означало чистить, расчищать. То есть Честоки — это селение на расчищенной земле. Менее вероятна, но возможна связь с некалендарным именем-прозвищем Честока (от «честь» или «честной»), но топонимическая версия убедительнее: слишком редким было бы такое прямое прозвище.

Суффикс -ин указывает на принадлежность. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые образуются от имён на согласный, -ин крепится к основам на -а/-я. Если бы предка звали Честок, он стал бы Честоковым. А Честокин — это «чей?» — сын человека из Честок. Такая модель типична для северных и центральных областей России, где топонимические фамилии на -ин широко распространены.

Фамилия редкая, в дореволюционных справочниках почти не встречается. Это говорит о том, что род был локальным, невыдающимся по сословному статусу — скорее всего, крестьяне или однодворцы, жившие в одной местности. В современной России фамилия Честокина тоже малочисленна, что подтверждает её «точечное» происхождение.

Двойственность написания (Честокина / Чистокина) — не ошибка, а следствие «акающего» произношения: в безударном положении «е» и «и» звучали одинаково. В документах могли записать на слух, отсюда варианты. Если ваши предки из тех мест, где «окали», скорее всего, исходная форма — Чистокин.