Фамилия Чичкунов — редкая и неочевидная с первого взгляда. Её основа — не «чичк» и не «чикч», а древнерусское прозвище Чичкан или Чичка, которое в разных говорах означало одно и то же: задиру, драчуна или человека с торчащим, «кудлатым» видом. В словаре Владимира Даля «чичкаться» — возиться, мешкать, но в ономастике чаще опираются на другое значение: «чичка» — шишка, выпуклость, а в переносном смысле — заноза, тот, кто лезет в драку.

Суффикс -унов указывает на отчество от прозвища Чичкан. Сначала, в XVI–XVII веках, появилась форма Чичканов — от имени Чичкан (документально известно, что такие имена давали в Новгородских землях). Позже, в южнорусских и украинских говорах, под влиянием местной фонетики или просто из-за быстрого произношения, «Чичканов» превратилось в «Чичкунов»: звук «а» в безударном положении редуцировался, а на письме закрепился вариант с «у». Это не ошибка, а типичный диалектный сдвиг.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с тюркским словом «чик» — граница или «чичкан» — мышь. Но в русских фамилиях тюркские корни обычно сохраняют узнаваемую форму (Чичкаев, Чичканов), а вариант Чичкунов слишком далеко ушёл от исходника. Поэтому правдоподобнее считать его чисто русским, образованным от прозвища Чичкан.

Носители фамилии Чичкунов исторически концентрировались в центральных и южных губерниях России — Курской, Воронежской, а также на Дону. Сословная принадлежность чаще всего крестьянская или однодворческая. Встречается фамилия и у донских казаков, что подтверждает её связь с вольным, неспокойным нравом: прозвище «Чичкан» как раз подходило для бойкого казака.

Однокоренные фамилии — Чичканов, Чичкин, Чичков, Чичканёв. Все они держатся на одном корне, но Чичкунов выделяется редким суффиксальным вариантом, который в современных справочниках часто путают с украинскими фамилиями на -ун. На самом деле это чисто русская модель, просто менее распространённая, чем стандартное -ов.