Фамилия Чиликова — женская форма фамилии Чиликов, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — прозвище или неканоническое имя Чилик. Слово «чилик» в русских говорах имеет несколько значений, и каждое могло стать источником фамилии.

Самая вероятная версия отсылает к ремеслу или мелкой торговле. В южнорусских и волжских диалектах «чилик» — это мелкая монета, полушка или деньга. Прозвище Чилик могли дать человеку, который торговал по мелочи, был прижимистым или, наоборот, тем, кто считал каждую копейку. В этом случае фамилия Чиликов — типичная «профессиональная» фамилия, образованная от прозвища по роду занятий.

Вторая версия — зоологическая. В орнитологии чиликом называют небольшого кулика, птицу из семейства бекасовых. Прозвище Чилик мог получить охотник, птицелов или человек, чем-то напоминавший эту птицу — например, суетливый, быстрый или невысокого роста. Такие «птичьи» прозвища часто становились фамилиями, особенно в крестьянской среде.

Третья, менее распространённая версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В ряде тюркских языков «чилик» означает «молодой», «зелёный», «незрелый». Если предки Чиликовых жили в регионах с тюркским населением, прозвище могло указывать на молодость или неопытность носителя.

Фамилия образована с помощью патронимического суффикса -ов, что характерно для русских фамилий, сформировавшихся в XV–XVII веках. Суффикс указывает на принадлежность: Чиликов — сын Чилика. Встречается фамилия преимущественно в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской и Ростовской областях, что подтверждает связь с южнорусской диалектной лексикой.

Сословная принадлежность предков Чиликовых не закреплена жёстко. Судя по основе, это могли быть как крестьяне, так и посадские люди, занимавшиеся мелкой торговлей. Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах не зафиксировано, что делает её типичной крестьянско-мещанской фамилией, возникшей из бытового прозвища.