Фамилия Чипанина — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Самое вероятное объяснение связано с диалектным словом «чипан» — так в некоторых русских говорах, особенно на Урале и в Сибири, называли грубую, неотёсанную деревянную посуду, черпак или ковш, выдолбленный из дерева. Прозвище Чипан могли дать мастеру, делавшему такую утварь, или же человеку с грубоватой внешностью и манерой поведения. Фамилия образована по типичной модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Чипанин, то есть сын или потомок Чипана. Женская форма Чипанина — естественное окончание, закрепившееся в роду.

Менее убедительная, но возможная версия — связь с тюркским корнем «чипан», означающим «потомок, отпрыск», что могло быть личным именем в татарской или башкирской среде. Однако в таком случае фамилия чаще писалась бы через «-ов» (Чипанов), а не «-ин». Форма на -ин характерна для основ на -а, -я, и она указывает на славянскую, скорее всего русскую, словообразовательную модель.

Географически фамилия Чипанина встречается в основном в Пермском крае, Свердловской области и на юге Урала — именно там бытовало слово «чипан» в значении деревянной посуды. В этих краях было много лесных промыслов, и прозвища по ремеслу давали людям часто. Сословная принадлежность предков, скорее всего, — крестьяне или ремесленники, но точных данных нет. Фамилия не дворянская и не купеческая, в списках известных родов она не значится.

Если сравнивать с однокоренными, то фамилия Чипанов встречается чаще, и её носители могут быть как из той же диалектной среды, так и из тюркской. Чипанина же — более редкий вариант, сохранивший старую модель без оглушения или перехода окончания. В написании фамилии нередко путают: встречается вариант «Чепанниа» или «Чипанова», но исторически верная форма — через «и» и с двойной «н» только в корне.