Фамилия Чирликова — женская форма фамилии Чирликов, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем, которое легло в основу мужского варианта. Чтобы понять корни, нужно разобрать словообразовательную модель: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Чирликов), а основа «Чирлик» восходит к тюркскому или диалектному русскому слову.

Наиболее вероятная версия — происхождение от тюркского имени Чирлик или прозвища, образованного от корня «чир» (в тюркских языках — «гниль», «сырость», «болото», а также «рана», «язва»). В таком случае Чирликом могли называть человека, жившего у болотистой местности, или того, кто имел отношение к лечению ран (знахаря). В тюркских ономастических традициях подобные имена нередко давали как обереги — чтобы «нечистое» имя отпугивало злых духов.

Вторая, менее распространённая версия связывает фамилию с русским диалектным словом «чирка» (уменьшительное от «чирок» — вид утки) или «чирлик» (уменьшительное от «чирок»). Тогда прозвище мог получить охотник или человек, похожий на утку (например, быстрой походкой или внешностью). Однако эта гипотеза слабее: тюркский корень даёт более органичное объяснение для фамилии с акающим окончанием -ов, типичным для южнорусских и поволжских регионов, где тюркское влияние было сильным.

Географически фамилия Чирликова встречается в основном в Поволжье, на Урале и в Сибири — регионах, где русские переселенцы контактировали с тюркскими народами (татарами, башкирами, чувашами). Это подтверждает версию о тюркской основе. Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к крестьянам или однодворцам, но точных данных о дворянских ветвях нет.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Чирков, Чиркин, Чириков — показывает, что Чирликов выделяется редким суффиксом -лик, который в русских фамилиях встречается нечасто и обычно указывает на заимствование из тюркских языков (ср. Батырликов, Кутузликов). Таким образом, Чирликова — фамилия с чёткой региональной и этнической привязкой, а её носители, вероятно, происходят от человека с тюркским корнем, который со временем обрусел.