Фамилия Чистобаев является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Чистобаев произошла от прозвища Чистобай. Вероятно, оно образовано от словосочетания чисто баящий, то есть правильно выговаривающий слова. Таким образом, можно предположить, что так могли называть человека, отличавшегося правильной речью и отсутствием говора. В республике Хакасия существует село Чистобай. Возможно, человек, получивший прозвище Чистобай, был выходцем из этого населенного пункта. Есть мнение, что в основе прозвища лежат два слова «чистый» и «бай», которое переводе с древнетюркского означает «богатей, господин, повелитель». В этом случае это прозвище могло указывать на социальное положение его носителя. Предположительно, основатель рода Чистобаевых относился к знатному роду, был «чистых кровей». Так и прозвище Чистобай закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Чистобаев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чистобай, со временем получил фамилию Чистобаев. Безусловно, фамилия Чистобаев представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Чистобаев можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.