Фамилия Чистоев — пример, где прозрачная на первый взгляд основа таит в себе неожиданный поворот. Кажется, что она связана со словом «чистый», но в русской ономастике это редкий случай: чаще всего фамилии с корнем «чист-» (Чистов, Чистяков, Чистиков) образованы от прозвища «Чистяк» или «Чистый», указывавшего на опрятность, аккуратность или даже на человека, который «чистил» — например, рыбу или кожу. Однако Чистоев стоит особняком из-за суффикса -ев, который обычно указывает на притяжательность от имени или прозвища на мягкий согласный (Иван — Иванов, но Илья — Ильин; Чистый — Чистов, а не Чистоев).

Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища Чистой — устаревшей формы прилагательного «чистый» в значении «чистоплотный, непорочный, честный». В русских говорах, особенно северных и сибирских, встречалось слово «чистой» как полное прилагательное (ср. «молодой» — «молодой человек»). Отсюда и фамилия: Чистой → Чистоев, по той же модели, что и Доброй → Доброев, или Хитров (от «хитрой»). Такая модель образования — от полной формы прилагательного в именительном падеже — характерна для XVI–XVII веков, когда прозвища нередко застывали в этой форме.

Менее убедительная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «чист» — в некоторых языках (например, татарском) «чистай» означает «чистый, ясный». Однако носители фамилии Чистоев исторически фиксируются прежде всего в русских регионах: в переписях XIX века встречаются крестьяне Чистоевы в Вятской и Пермской губерниях, что скорее говорит о русском происхождении. Тюркская версия, хотя и возможна для южных областей, для этой фамилии остаётся гипотетической.

Интересно, что фамилия Чистоев не имеет распространённых однокоренных «двойников» с другим суффиксом — например, Чистов встречается в десятки раз чаще. Это делает Чистоева более редкой и локальной: она могла закрепиться в одном-двух селениях, где прозвище Чистой передавалось по наследству без изменений. Если ваши предки носили эту фамилию, они, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, получившими прозвание за безупречную репутацию или за привычку содержать себя и дом в порядке.