Фамилия Чкахина — женская форма фамилии Чкахин, и её разбор стоит начать с мужского варианта, который встречается редко и звучит необычно для русского уха. В основе лежит слово «чках» или «чкать», что в русских говорах означало «чавкать», «чмокать», а также «брызгать», «плескать». Вероятнее всего, прозвище Чкахин или Чкаха дали человеку с небрежной, сюсюкающей речью или тому, кто издавал характерные звуки при еде. Такие прозвища по поведению — «Говорун», «Молчун», «Чавка» — были распространены в крестьянской среде, где внешние манеры или голос служили яркой приметой.

Модель образования фамилии типична для русского севера и северо-запада: суффикс -ин указывает на принадлежность к роду: «чей?» — Чкахиных, то есть потомков Чкахи. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще встречаются в центральных и южных регионах, -ин характерен для новгородских, псковских и архангельских земель. Это позволяет предположить, что предки носителей фамилии жили именно там, где говор сохранил древние черты.

Есть и другая, менее очевидная версия: основа могла быть связана с диалектным глаголом «чкахнуть» — ударить, стукнуть. В этом случае прозвище Чкаха мог получить драчун или человек с резкими, порывистыми движениями. Однако эта гипотеза слабее, так как звукоподражательное значение «чавкать» фиксируется в словарях чаще и логичнее объясняет происхождение прозвища.

Фамилия Чкахина не имеет отношения к грузинской фамилии Чхеидзе или к известному лётчику Чкалову — это чисто русская, диалектная фамилия, которая почти не встречается за пределами северных областей. В современных базах данных она редка, что делает её особенно ценной для генеалогии: узкая география бытования сужает круг поиска предков до конкретных деревень или уездов.