Фамилия Чубаев образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Чубаев образована от прозвища Чубай. Оно ведет свое начало от нарицательного «чуб» - «хохол, вихор, взбитый или отращенный локон». Согласно другой версии, прозвище Чубай восходит к украинскому глаголу «чубити» - «колотить», «бить кого-либо, хватая за чуб». В таком случае Чубаем называли вспыльчивого, горячего человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чубай, со временем получил фамилию Чубаев. О точном месте и времени возникновения фамилии Чубаев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Чубаев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.