Фамилия Чучугина — женская форма фамилии Чучугин, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем Чучуга. Разговор о ней стоит начать не с корня, а с суффикса: окончание -ин указывает на принадлежность (чей? — Чучугин), то есть «сын Чучуги» или «человек из семьи Чучуги». Такая модель в русских фамилиях типична для прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я.

Ключевой вопрос — что такое «Чучуга». Самая вероятная версия связывает основу с диалектным словом «чучка» или «чучундра» — в некоторых говорах так называли чумазого, грязного человека или неряху. Сравните с украинским «чучуня», что значит «замарашка». Прозвище Чучуга могли дать неопрятному ребёнку или взрослому, который не следил за одеждой. В ономастике есть параллели: фамилии Чучкин, Чучков образованы от того же корня, но с разными суффиксами.

Менее распространённая, но правдоподобная версия — связь с тюркским «чучук» (цыплёнок, птенец) или «чочок» (свинья, поросёнок). В контактных зонах русских и тюркских народов (Поволжье, юг России) такие прозвища приживались легко. Если предок носил имя Чучуга, это могло быть искажённое тюркское ласкательное прозвище, не обязательно обидное.

Географически фамилия Чучугин/Чучугина редкая. Она встречается в основном в Центральной России и Поволжье, особенно в Рязанской, Тамбовской и Нижегородской областях. Это указывает на крестьянское происхождение: фамилия закрепилась в среде, где прозвища давали по внешним признакам или поведению.

С точки зрения словообразования, фамилия Чучугина стоит в ряду с такими же краткими притяжательными формами, как Сорокина, Козулина, Грязнова. Никаких дворянских корней или родства с известными историческими родами у неё нет — это типичная «бытовая» фамилия, которая возникла в XVI–XVII веках, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам. Единственная особенность, отличающая её от однокоренных, — необычный звуковой повтор «чу-чу», который делает фамилию запоминающейся, но не меняет её простого значения: фамилия говорит о предке, которого прозвали за неопрятность или, в тюркской версии, за маленький рост или детскую внешность.