Фамилия Чунижекова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы разобраться в её основе, нужно отбросить типичные для русских фамилий суффиксы и присмотреться к корню.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия образована с помощью суффикса -ов- (в женской форме -ова), который указывает на принадлежность: «чей?» — Чунижеков. Основа же — Чунижек — явно тюркского происхождения. Это не русское прозвище, а скорее искажённое или адаптированное личное имя.

Наиболее вероятная версия: в основе лежит тюркское имя Чунижек, которое может быть составным. Первая часть — «чуни» — могла восходить к слову «чун» (в некоторых тюркских языках — «душа», «дух») или к имени Чуна (уменьшительное от Чунак, Чунаш). Вторая часть — «жек» — это уменьшительно-ласкательный суффикс в казахском, киргизском и других тюркских языках (аналог русского -ек/-ик). Таким образом, Чунижек могло означать «маленький Чуна» или «душенька». Другой вариант: корень «чун» мог быть связан со словом «чунгур» (овраг, низина) — тогда прозвище давали по месту жительства.

Географически фамилия Чунижекова тяготеет к Южному Уралу и Западной Сибири, особенно к регионам, где исторически соседствовали русские и тюркские народы (башкиры, казахи, татары). Это типичная фамилия-маркёр межэтнических контактов: тюркское имя обрусело через добавление русского суффикса -ов. В дореволюционных списках она почти не встречается — скорее всего, фамилия оформилась поздно, в XIX — начале XX века, когда крестьянам и казакам массово закрепляли фамилии по отцу.

Интересная деталь: написание с «жек», а не с «шек» или «чек» указывает на звонкое произношение в исходном языке. В тюркских языках звук «ж» часто переходит в «ш» (ср. казахское «жол» — дорога, но в русской передаче «шол»), но здесь сохранился звонкий вариант. Это может говорить о том, что фамилию записывали со слов носителя, а не через письменный источник.

Сословно предки Чунижековых, скорее всего, были крестьянами или казаками (в Оренбургском или Сибирском казачьем войске). Дворянских родов с такой фамилией не известно. В современной России фамилия остаётся редкой, что делает её ценным маркёром локальной семейной истории.