Фамилия Чуйнов — один из тех случаев, когда внешне прозрачная основа таит в себе неожиданный поворот. На первый взгляд, корень «чуй» напрашивается на связь с глаголом «чуять» (нюхать, предчувствовать). Однако в русских фамилиях этот глагол почти не встречается в качестве прозвища напрямую. Гораздо вероятнее, что в основе лежит тюркское имя или прозвище Чуй, которое было широко распространено среди татар и башкир. В тюркских языках «чуй» означает «слух», «молва», а также «слава» или «известие». Так могли назвать человека, который приносил новости, был вестником, или же того, о ком много говорили.

Модель образования проста: к основе Чуй добавили русский патронимический суффикс -ов, что означает «сын Чуя». Фамилия оформлена по общерусскому образцу, но её корни уходят в среду, где русские и тюркские народы веками жили рядом. Географически Чуйновы чаще всего встречаются в Поволжье — в Нижегородской, Самарской, Ульяновской областях, а также в Татарстане. Это регионы активного смешения населения, где фамилии с тюркской основой и русским окончанием — обычное дело.

Есть и более редкая, бытовая версия: в некоторых говорах «чуй» — это диалектное название чугуна или чугунка, но она слабая и не подкреплена массовыми данными. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» Чуйнов не упоминается отдельно, но разбор однокоренных фамилий (Чуйкин, Чуйков) подтверждает тюркскую версию.

Таким образом, предок Чуйновых, скорее всего, был человеком с тюркским именем Чуй — «вестник» или «славный». Фамилия закрепилась в русской среде, сохранив память о межэтнических контактах, которые формировали население средней Волги.