Данилушкин — фамилия, которая прямо указывает на имя предка. В её основе лежит уменьшительная форма Данилушка от крестильного имени Даниил (в народном звучании — Данила). Имя древнееврейского происхождения, означает «Бог — мой судья». Фамилию получил потомок человека, которого в быту звали ласково Данилушкой: так на Руси называли и детей, и взрослых в кругу семьи или близких.

Обратим внимание на суффикс. В русских фамилиях модель на -ин (Данилушкин) обычно образуется от основ, оканчивающихся на -а или -я. Здесь исходное прозвище Данилушка — как раз такого типа. Суффикс -ушк- придаёт имени оттенок особой нежности, что встречается в фамилиях, образованных от домашних, внутрисемейных имён: Ванюшкин, Мишуткин, Алёшкин. По той же логике сложился и Данилушкин.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным регионам России, где была распространена модель на -ин и где имя Даниил в форме Данила звучало особенно часто. Встречается она и в Поволжье, и на Урале — везде, где оседали крестьяне или посадские люди, чьи имена записывали в переписные книги.

С точки зрения социальной истории, носитель фамилии Данилушкин в большинстве случаев происходил из крестьянской или мещанской среды. Дворянство такие фамилии на -ин с уменьшительным суффиксом почти не использовало — они оставались в народной толще. Это не делает фамилию менее интересной: за ней стоит живая традиция называть человека ласково, по-домашнему, и передавать это прозвание детям как родовое.

Есть и редкая версия, которую ономасты почти не рассматривают всерьёз: будто основа — не имя, а прозвище от диалектного слова «данилушка» в значении «простак» или «растяпа». Но она слабая: ни в одном известном словаре русских говоров такое значение не зафиксировано, а имя Даниил было настолько распространено, что объяснение через него куда естественнее.