Фамилия Дарьюшкин — это типичная «малая» русская фамилия, образованная от имени Дарьюшка. Так в быту, ласково, называли девочку или женщину по имени Дарья. Корень здесь очевиден: Дарья — одно из самых распространённых женских имён в России, греческого происхождения (означает «сильная», «побеждающая»). Суффикс -ушк- придаёт уменьшительно-ласкательный оттенок, а фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Дарьюшкин, то есть сын, внук или человек из семьи Дарьюшки.

Обычно такие фамилии закреплялись за детьми, чья мать или бабушка носила имя Дарья. В крестьянской среде, где женщин часто называли по мужу или отцу, фамилия по материнскому имени — явление нередкое. Если в семье была вдова Дарья или просто властная, уважаемая женщина с этим именем, её детей могли записать как Дарьюшкины. Иногда так называли и внебрачного ребёнка, которого воспитывала одна мать.

Словообразовательная модель с двойным суффиксом (-ушк- + -ин) встречается реже, чем простые формы вроде Дарьин или Дашин. Это делает фамилию более «домашней», неофициальной по происхождению. В документах XIX века такие фамилии чаще фиксировались в северных и центральных губерниях России, где был распространён «материнский» тип фамилий (сравните: Машков, Наташкин, Катюшкин).

В современном русском языке фамилия Дарьюшкин — редкая. Её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких локальных родов, а не из обширного ареала. Попытки связать её с литовским или балтским корнем «дарьюс» (дар) выглядят натянутыми: русская модель с суффиксом -ин и уменьшительным суффиксом -ушк- указывает на славянскую, бытовую основу без альтернатив.