Фамилия Динегина — женская форма фамилии Динегин. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: «чей?» — Динегин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Динега.

Основа фамилии — прозвище Динега. Его происхождение неочевидно, и здесь есть несколько версий, разной степени достоверности. Наиболее вероятная связь — с диалектным словом «диня» или «диняга». В южнорусских и украинских говорах так называли дыню. Прозвище Динега могли дать любителю дынь, торговцу ими или, в переносном смысле, полному, круглолицему человеку — по ассоциации с формой плода. Менее убедительна версия о связи с тюркским словом «дине» (вера, религия) — для русской фамилии это маловероятно, так как в основе чаще лежат бытовые, а не идеологические прозвища. Ещё одна гипотеза — от глагола «динить» в значении «бить, колотить» (в некоторых говорах), тогда Динега могло быть прозвищем драчуна или задиры. Но эта версия менее распространена.

Примечательно, что фамилия Динегин/Динегина — редкая. Она практически не встречается в исторических документах и современных справочниках массовых фамилий. Это говорит о том, что она могла возникнуть в локальной среде, в одном или нескольких сёлах, и не получила широкого распространения. Скорее всего, предки носителей фамилии были крестьянами или посадскими людьми из южных губерний России, где бытовало слово «диня».

С точки зрения словообразования, фамилия стоит в ряду с другими «растительными» прозвищами: Репин (от репа), Тыквин, Огурцов. Но если Репины или Огурцовы — фамилии частые, то Динегины сохранили свою локальную уникальность. Суффикс -ин, а не -ов, также указывает на то, что прозвище оканчивалось на -а, что характерно для прозвищ, а не для канонических имён.