Фамилия Дижонова — женская форма, а её мужской вариант — Дижонов. В основе, скорее всего, лежит не французский город Дижон, как может показаться на первый взгляд, а русское прозвище или имя. Правдоподобнее всего версия, что корень «диж-» восходит к диалектному глаголу «дижать» или «дыжать» — в некоторых говорах так называли тяжело дышать, задыхаться, пыхтеть. Человек с таким прозвищем мог быть тучным, страдать одышкой или просто иметь привычку громко, шумно дышать. Суффикс -он- в этой модели указывает на принадлежность: Дижон — буквально «тот, кто дижит», то есть пыхтит. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Дижо́нов.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с каноническим именем Дий (редкая форма от Дионисий). В таком случае Дижон — это производная форма имени с суффиксом -он, как, например, Мирон от Мир. Однако для фамилий на -онов типичнее основа от прозвища или мирского имени, а не от крестильного. Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных и южных областях России, что подтверждает её диалектное происхождение.

Словообразовательная модель проста: основа «Дижон» + патронимический суффикс -ов. Это типичная русская фамилия, образованная от прозвища без дополнительных суффиксов, то есть напрямую от личного имени или прозвища в форме, закрепившейся в быту. Социальный контекст: предки носителей фамилии, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, поскольку прозвища по физическим особенностям — характерный признак простонародной среды.