Фамилия Длугин — редкая и на первый взгляд неочевидная по происхождению. Её основа — «длуг» — сразу выдает польское или белорусское влияние: в этих языках «длуги» (długi) означает «длинный». В русском языке аналогичное слово звучало бы как «долгий», поэтому фамилия Длугин — это по сути тот же Долгин, но с западнославянским фонетическим отпечатком. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Длугин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Длугий (Длинный).

Прозвище Длугий могли дать высокому, долговязому человеку. В старину такие именования были распространены повсеместно, но в западных регионах Российской империи — на территории современной Беларуси, Украины и в пограничных с Польшей губерниях — они часто закреплялись именно в такой форме. В польской ономастике фамилия Długi встречается нередко, а её русский аналог Длугин — результат адаптации: носитель мог переехать в центральную Россию, где окончание привели к привычному -ин.

Версия о связи с корнем «друг» (через чередование г/ж) маловероятна: форма «длуг» нехарактерна для древнерусского языка, а вот польское długi — прямое и прозрачное слово. Поэтому основная гипотеза — прозвище по росту. Географически фамилия встречается рассеянно, без ярко выраженного гнезда, но чаще всего её носители имеют корни из западных областей бывшей Речи Посполитой. Сословной привязки нет: Длугиными могли быть и крестьяне, и мещане, и шляхта, получившая фамилию от того же прозвища.