Фамилию Долхонова стоит разбирать с её географической привязки — это редкий случай, когда корень почти наверняка указывает на конкретную местность. Основа «долхон» или «долхан» восходит к топониму Долханы — так называются несколько деревень в Псковской области (например, Долханы в Гдовском районе). Жителей этих мест могли прозвать «долханами», а их потомки получили фамилию Долхоновы. Форма на -ова указывает на женскую линию или на принадлежность к роду (чьей-то жене или дочери), но в бытовом употреблении фамилия закрепилась в обоих вариантах — мужском и женском.

Сам топоним Долханы, скорее всего, балтийского происхождения. Псковщина — зона древнего контакта славян с балтскими племенами (латгалами, селами). Корень «dol-» в балтийских языках означает «дол», «низина», а суффикс «-ан» характерен для названий мест по природным признакам. Таким образом, Долханы — это «деревня в низине». Фамилия Долхонова, следовательно, означает «родом из Долхан» или «принадлежащая к долханским».

Интересна суффиксальная модель. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев (Иванов, Петров), здесь суффикс -он-ов встречается реже. Он характерен для фамилий, образованных от прозвищ или названий, оканчивающихся на -а, -я: Долханы → Долхонов. Аналогичные примеры — Болхонов (от Болханы), Крохонов (от Кроханы). Это подтверждает, что фамилия не случайна, а следует определённой региональной словообразовательной традиции, вероятно, северо-западной. Найти «Долхонову» в метрических книгах XIX века скорее всего можно в Псковской или соседних губерниях — Новгородской, Петербургской. За пределами этого ареала фамилия встречается редко, что делает её своеобразным маркером происхождения предков.