Фамилия Доногуев происходит от личного имени или прозвища Доногуй. В его основе лежит черкесское слово «дэнагъу» — «светло-коричневый». Скорее всего, так прозвали человека за русый цвет волос или другой внешний признак, связанный с этим оттенком.

Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ев, который присоединяли к основам, оканчивающимся на согласный или й. В данном случае он добавился к исходному имени Доногуй, и получилось Доногуев — «сын Доногуя». Такая схема характерна для многих фамилий, возникших на Кавказе и в других регионах, где русская администрация фиксировала местные имена и прозвища по своему шаблону.

Слово «дэнагъу» встречается в адыгских языках, поэтому фамилию стоит связывать с адыго-черкесской средой. Носители фамилии Доногуевы — это потомки человека, которого окружающие запомнили по цвету волос. Фамилия закрепилась в документах и передавалась по мужской линии, как это было принято в Российской империи XIX века при оформлении сословных списков и метрических книг.

С точки зрения словообразования, фамилия редкая: основа Доногуй не имеет широко распространённых параллелей в русском именослове, а её прозрачная этимология указывает именно на кавказское происхождение. В отличие от фамилий на -ов от христианских или тюркских имён, Доногуев стоит особняком как памятник адыгской лексики, зафиксированный в русской фамильной форме.