Фамилия Дойндоков — редкий пример, где разбор упирается не в славянский корень, а в тюркскую или монгольскую основу. Скорее всего, в её центре лежит имя или прозвище Дойндок. В тюркских языках «дой» (doy) может означать «сытость», «насыщение», а также «праздник» или «пир». В монгольских языках встречается близкое «дойн» — «война», «сражение». Прибавив к этому уменьшительно-ласкательный суффикс -ок, получим Дойндок — «сытый», «праздничный» или, по другой версии, «воинственный». Точное значение зависит от того, из какого именно языка пришло слово.

Фамилия образована по русской патронимической модели: к основе Дойндок прибавили суффикс -ов, означающий «чей?», «сын кого?». Дойндоков — буквально «сын Дойндока». Суффикс -ов типичен для фамилий, возникших в среде, где русский язык взаимодействовал с тюркскими и монгольскими языками, особенно на юге России, в Поволжье, на Урале и в Сибири. Именно там, в зоне контакта культур, и могла появиться эта фамилия.

Географически фамилия Дойндоков почти не встречается в центральных областях России. Её носители, если судить по данным современных телефонных справочников и архивов, сосредоточены в Калмыкии, Астраханской области и на Северном Кавказе. Это косвенно подтверждает монгольскую (калмыцкую) или тюркскую (ногайскую, кумыкскую) версию происхождения. Предок-носитель такого прозвища мог быть кочевником, скотоводом или воином, а после перехода к оседлости или крещения получил фамилию по имени отца.

В русском языке слово «дойндок» не имеет самостоятельного значения. Фамилия не связана ни с каким русским диалектным словом или ремеслом. Это чистый пример того, как иноязычное имя или прозвище «обрусело» через суффикс, став фамилией для потомков человека, который когда-то носил необычное для русского уха прозвище.