Фамилия Дуденкова — женская форма, образованная от мужской Дуденко. Её основа — прозвище Дуда, которое давали в старину человеку, связанному с музыкой. Чаще всего так называли того, кто сам играл на дудке или делал такие инструменты на продажу. Впрочем, прозвище могло закрепиться и за весёлым плясуном, который не расставался с дудкой.

Суффикс -енко в фамилии Дуденко — типичная восточноукраинская модель. На землях современной Украины и южных русских областей фамилии с этим суффиксом означали «сын» или «потомок»: Дуденко — буквально «сын Дуды». Со временем, при переходе в русскую традицию, фамилия получила окончание -а в женском роде.

Само прозвище Дуда — не единичный случай. Родственное ему Дудка встречается в документах уже в первой половине XV века: в архивах упоминается Дудка Фёдор Дмитриевич Зайцев. Это показывает, что прозвище было в ходу давно и не считалось обидным — скорее, указывало на характерное занятие или заметную черту человека.

Таким образом, Дуденкова — фамилия, которая ведёт род к человеку с прозвищем Дуда, скорее всего музыканту-дударю или ремесленнику, делавшему дудки. География фамилии тяготеет к южнорусским и украинским областям, где суффикс -енко был основным способом образовать фамилию по отцу.