Фамилия Дудякова — женская форма, парная к мужской Дудяков. В основе лежит прозвище Дудяк, и здесь есть две версии происхождения, и первая из них заметно правдоподобнее.

Самая вероятная версия связывает прозвище Дудяк с музыкальным инструментом — дудой. На Руси дударём или дудяком называли того, кто играл на дудке, волынке или жалейке. Это был не просто музыкант, а зачастую бродячий скоморох или пастух, который развлекал народ на ярмарках и свадьбах. Фамилии, образованные от названий музыкальных инструментов и музыкантов, встречаются повсеместно, но в случае с Дудяковым есть любопытная деталь: суффикс -як указывает на лицо, для которого занятие было характерным, почти профессиональным. Дудяк — это не тот, кто дудит от случая к случаю, а тот, кто постоянно при деле, вроде Рыбака или Гончара.

Вторая версия, менее распространённая, выводит прозвище из диалектного слова «дуда» — так в некоторых говорах называли полного, пухлощёкого человека или же неуклюжего, медлительного. Но семантика здесь слабее: прозвища по внешности обычно более образны и конкретны, а «дуда» в этом значении встречается редко и локально.

Суффикс -ов в мужской форме Дудяков — стандартный патронимический, то есть «сын Дудяка». Фамилия не относится к числу древних аристократических, а скорее крестьянская или посадская, характерная для северных и центральных губерний России. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища: Дудяки могли быть прозваны в одном селе или волости, и фамилия осталась компактной, не разойдясь широко по стране. В современных справочниках фамилия Дудяков фиксируется в основном в Пермском крае, Кировской и Нижегородской областях — регионах, где традиционно была сильна культура пастушества и народных музыкантов.