Фамилия Духарева — женская форма фамилии Духарев. Её основа, при всей кажущейся простоте, таит в себе неожиданный поворот. Самое прямое и напрашивающееся объяснение — связь со словом «дух» (запах). Однако в русских говорах слово «духарь» имело несколько значений, и не все они были лестными.

Чаще всего Духаревыми становились потомки человека, которого в округе прозвали Духарем. В разных регионах так могли называть либо обладателя сильного, резкого запаха (например, курильщика, либо человека, работавшего с дегтем или кожей), либо, наоборот, того, кто славился своим «духом» — то есть нравом. В некоторых диалектах «духарь» — это гордец, зазнайка, человек с «духом» (характером), который держится независимо и свысока. Есть и более прозаичная версия: на Севере и в Сибири «духарем» называли душника — человека, который плохо пахнет, неряху.

Менее вероятна, но возможна связь с именем Духарий — редкой формой крестильного имени Евдоким (в просторечии Овдоким, Дух). В таком случае фамилия образована от краткой формы имени через суффикс -ев, указывающий на принадлежность: «сын Духара», то есть сын Евдокима. Однако эта версия уступает прозвищной, так как имя Духар не было широко распространено, а прозвище Духарь встречается в писцовых книгах XVII века.

Суффикс -ев в фамилии указывает на её происхождение от основы, оканчивающейся на мягкий согласный или шипящий (Духарь → Духарев). Это типичная модель для русских фамилий центральных и северных губерний. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская: прозвища, связанные с внешними качествами или чертами характера, были обычным делом в среде простого люда.

Таким образом, ваш предок по мужской линии, скорее всего, получил своё прозвище от окружающих либо за свой крутой или гордый нрав, либо за неопрятность. Первая версия — «гордец» — исторически более распространена и менее обидная, чем вторая.