Фамилия Душуткин образована от мирского имени Душутка. В основе этого имени лежит слово «дух», но не в значении «сверхъестественное существо», а в значении «душа». То есть Душутка — это «наделённый душой», «дышащий» или попросту «живой». Это одна из наиболее прямых версий происхождения.

Есть и другое объяснение: имя Душутка могло быть уменьшительной формой южнославянского имени Духослав. В этом случае, называя так ребёнка, ему желали силы воли, твёрдого духа и благородных поступков, чтобы он прославился ими. Третья версия отсылает к украинскому слову «душак» — дятел. Согласно этой гипотезе, родители давали такое имя, чтобы природа приняла ребёнка как своего, а от птицы к нему перешли полезные качества.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Душутк- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Душутки). Такая модель типична для фамилий, возникших в центральных и северных регионах России. Географически фамилия редкая, что указывает на её локальное происхождение, возможно, из одной или нескольких соседних деревень. Однокоренных фамилий в русском языке почти нет, что делает Душуткиных носителями уникального прозвища, закрепившегося в роду.