Фамилия Дуйченбеков — редкий пример, где в основе лежит не русское, а тюркское имя, причём с необычной для русской традиции конструкцией. Её ядро — составное имя Дуйченбек, которое образовано по типичной для Средней Азии модели: «Дуйчен» (варианты — Дуйшен, Дуйшон) плюс компонент «бек» (господин, князь, предводитель). Первая часть восходит к персидскому «ду-шанбе» — «понедельник» (буквально «два» + «суббота», то есть второй день после субботы). Таким образом, Дуйченбек — это имя, данное мальчику, родившемуся в понедельник. В тюркских культурах имена по дням недели (Джумабай, Пайшанбай) были распространены, но приставка «бек» указывала на принадлежность к знатному или военному сословию.

Русский суффикс -ов превратил это имя в фамилию, адаптировав её в рамках канцелярской традиции Российской империи. Обычно такие фамилии фиксировались у оседлого населения, принявшего православие, или у крещёных представителей тюркских народов. Однако в случае Дуйченбекова не исключён и более поздний вариант: фамилия могла возникнуть в советское время при паспортизации в Киргизии или Казахстане, где окончание -ов добавляли к местным именам без изменения корня. Географически фамилия тяготеет к югу Кыргызстана (Ошская, Джалал-Абадская области) и приграничным районам Узбекистана — именно там имя Дуйшен встречается чаще всего.

Корень «Дуйчен» иногда путают с монгольским «дуйчин» (четыре), но это ложное сближение: в тюркских языках числительное «четыре» звучит иначе (төрт, дөрт). Версия с понедельником подтверждается и тем, что в фамилии встречаются варианты Дуйшенбеков, Дуйшонбеков — все они указывают на один и тот же день недели. Социально предки носителя фамилии, скорее всего, не были рядовыми кочевниками: компонент «бек» в имени говорит о том, что родоначальник принадлежал к местной аристократии или хотя бы к уважаемому роду старшин. Фамилия не имеет отношения к русским словам «дуть» или «дуй» — это чисто тюркское заимствование, прошедшее через русскую паспортную систему.