Фамилия Дуйдов — редкий пример, где тюркское слово дало основу, а русская модель образования закрепила её в виде отчества. Скорее всего, в основе лежит именование Дуйды, а оно, в свою очередь, восходит к тюркскому «дайда» — «быть разборчивым, притязательным». Такое прозвище могли дать человеку требовательному, капризному или придирчивому к мелочам.

Но есть и вторая версия. Если допустить связь с тюркским «дайди» — «бродящий, шатающийся», то прозвище Дуйды мог получить странник, бродяга или человек, который часто переезжал с места на место. Оба значения укладываются в логику прозвищ: они редко бывают нейтральными, почти всегда подмечают яркую черту — либо характер, либо образ жизни.

Сама фамилия образована по стандартной восточнославянской модели: к основе Дуйды прибавили суффикс -ов. Буквальный смысл — «сын Дуйды», «потомок того, кого звали Дуйды». Такая модель в XVI–XVII веках закрепилась как основная для фамилий крестьян и посадских людей, так что предки Дуйдовых, скорее всего, не принадлежали к высшим сословиям, а были простыми людьми — ремесленниками, крестьянами или служилыми по прибору.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных источниках и современных справочниках она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании — возможно, в районах с тюркоязычным окружением (Поволжье, Приуралье, юг Сибири). Именно там русское население активно заимствовало тюркские прозвища и переделывало их в фамилии.

С точки зрения словообразования фамилия проста: корень Дуйд- (от Дуйды) плюс суффикс -ов. Ударение, скорее всего, падает на первый слог: Ду́йдов. Вариант с ударением на последний слог менее вероятен, но не исключён в диалектной речи.