Фамилия Дуйшаева — характерный пример фамилий, образованных от тюркских личных имён, и её корни ведут в регионы со смешанным казахско-киргизским и узбекским населением. Основа фамилии — мужское имя Дуйша, которое, скорее всего, является диалектной или фонетической формой имени Дуйсен (от арабского «душанба» — понедельник). У тюркских народов, особенно у казахов и киргизов, было распространено давать мальчикам, родившимся в этот день, имя Дүйсенбай или просто Дүйсен. Вариант «Дуйша» мог возникнуть как сокращение или упрощение в устной речи — усечение конечного согласного и замена на «ша» (характерный ласкательный суффикс в тюркских языках, аналогичный русскому «-ш-» в именах типа Паша, Саша).

Суффикс «-ева» — классический русский патронимический формант, указывающий на принадлежность к роду: Дуйшаева буквально значит «дочь (или жена) Дуйши». Но в данном случае это не отчество, а уже закреплённая фамилия, которая перешла по женской линии или зафиксирована как вариант мужской формы Дуйшаев. Написание с «е» в суффиксе (а не с «ё» или «а») говорит о том, что фамилия прошла через русскую канцелярскую фиксацию в XIX–XX веках, когда тюркские имена записывали на слух, без учёта мягкости.

Географически фамилия Дуйшаева встречается в основном в Оренбургской области, на юге Урала и в Поволжье, а также среди казахов, переселившихся в Россию в советский период. Встречается она реже, чем её мужской аналог, — это указывает на то, что в роду, скорее всего, была сильная женская линия, либо фамилия закрепилась за женщиной, которая стала главой семьи после войны или в ходе коллективизации.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Дуйсенов, Дуйсенбаев, Дуйшеналиев) показывает, что Дуйшаева стоит особняком: в ней нет второго компонента (как «-бай» или «-али»), что делает её более «короткой» и, возможно, более древней по происхождению — имя без дополнительного титула могло принадлежать человеку не из знатного рода, а из простых скотоводов или крестьян. Таким образом, предки носительницы фамилии Дуйшаева — скорее всего, люди, называвшиеся по личному имени, без указания на социальный статус, и жившие в среде, где тюркские имена переходили в русский быт через устное общение, а не через официальные метрики.